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Unidade de Genômica da Biodiversidade (UGBio)

 

 

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Plataforma de Sequenciamento de Ácidos Nucléicos

Estrutura do Grupo

LÍDER DO GRUPO:

Inácio Junqueira

CIENTISTA DO GRUPO:

Milton Yutaka Nishiyama Jr.

PÓS-DOUTORANDA:

Úrsula Castro de Oliveira

TÉCNICA:

Mariana Salgado Morone

ESTUDANTES:

Diego Dantas Almeida

Pollyanna Campos


Sumário

A Unidade de Genômica da Biodiversidade (UGBio) desenvolve pesquisas de genômica e transcriptômica focadas principalmente no estudo de animais produtores de veneno ou de proteínas biologicamente ativas. Para isso são utilizadas técnicas de sequenciamento de ácidos nucléicos que vão desde a metodologia estabelecida por Gilbert e Sanger em 1977 até as tecnologias designadas NGS (Next Generation Sequencing).

Com a implantação do CeTICS, apoiado pela FAPESP, foi consolidado um parque de equipamentos adequado a esse tipo de análise. Uma equipe de técnicos e pesquisadores com experiência em técnicas de biologia molecular, sequenciamento de DNA e análise bioinformática opera o laboratório de forma integrada. Tal plataforma foi criada com a expectativa de não apenas permitir a execução dos projetos atuais do CeTICS como também fomentar o desenvolvimento de novos projetos no Instituto Butantan e em outras instituições de pesquisa.

Atualmente a UGBio está apta a auxiliar em projetos e análises que envolvam expertises e equipamentos de sequenciamento, como ilustrado abaixo. Caso tenha interesse em utilizar nossa estrutura, entre em contato conosco pelo email: O endereço de e-mail address está sendo protegido de spambots. Você precisa ativar o JavaScript enabled para vê-lo.


Publicações Selecionadas

Zelanis A, Andrade-Silva D, Rocha MM, Furtado MF, Serrano SM, Junqueira-de-Azevedo ILM, Ho PL. A Transcriptomic View of the Proteome Variability of Newborn and Adult Bothrops jararaca Snake Venoms. Plos Neglected Tropical Diseases. 2012;6(3):e1554.

Ching AT, Paes Leme AF, Zelanis A, Rocha MM, Furtado Mde F, Silva DA, Trugilho MR, da Rocha SL, Perales J, Ho PL, Serrano SM, Junqueira-de-Azevedo ILM. Venomics Profiling ofThamnodynastes strigatus Unveils Matrix Metalloproteinases and Other Novel Proteins Recruited to the Toxin Arsenal of Rear-Fanged Snakes. J Proteome Res. 2012 Feb 3;11(2):1152-62.

Leão LI, Ho PL, Junqueira-de-Azevedo ILM. Transcriptomic basis for an antiserum against Micrurus corallinus (coral snake) venom.BMC Genomics. 2009 Mar 16;10:112.

Junqueira-de-Azevedo ILM, Ching AT, Carvalho E, Faria F, Nishiyama MY Jr, Ho PL, Diniz MR. Lachesis muta (Viperidae) cDNAs reveal diverging pitviper molecules and scaffolds typical of cobra (Elapidae) venoms: implications in snake toxin repertoire evolution..Genetics (Austin), Estados Unidos. 2006 Jun;173(2):877-89.

Ching AT, Rocha MM, Paes Leme AF, Pimenta DC, de Fátima D Furtado M, Serrano SM, Ho PL, Junqueira-de-Azevedo ILM. Some aspects of the venom proteome of the Colubridae snake Philodryas olfersii revealed from a Duvernoy s (venom) gland transcriptome.FEBS Letters. 2006 Aug 7;580(18):4417-22.

Junqueira-de-Azevedo ILM, Ho PL. A survey of gene expression and diversity in the venom glands of the pitviper snake Bothrops insularis through the generation of Expressed Sequence Tags (ESTs).Gene (Amsterdam).2002 Oct 16;299(1-2):279-91.

Junqueira-de-Azevedo ILM, Farsky SHP, Oliveira MLS, Ho PL Molecular Cloning and Expression of a Functional Snake Venom Vascular Endothelium Growth Factor (VEGF) from the Bothrops insularis Pit Viper. A New Member of the VEGF Family of Proteins. The Journal of Biological Chemistry. 2001 Oct 26;276(43):39836-42.

 

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